保護部對進出口環(huán)保用微生物菌劑環(huán)境安全實施監(jiān)督管理。省、自治區(qū)、直轄市環(huán)境保護行政主管部門依照本辦法對轄區(qū)內(nèi)進出口環(huán)保用微生物菌劑環(huán)境安全實施監(jiān)督管理。國家質(zhì)量監(jiān)督檢驗檢疫總局統(tǒng)一管理全國進出口環(huán)保用微生物菌劑的衛(wèi)生檢疫監(jiān)督管理工作；國家質(zhì)量監(jiān)督檢驗檢疫總局設(shè)在各地的出入境檢驗檢疫機構(gòu)對轄區(qū)內(nèi)進出口環(huán)保用微生物菌劑實施衛(wèi)生檢疫監(jiān)督管理。

國家對進出口環(huán)保用微生物菌劑的環(huán)境安全管理，實行檢測和環(huán)境安全評價制度。環(huán)保用微生物菌劑進出口經(jīng)營者，應(yīng)當(dāng)是依法成立的從事生產(chǎn)或者使用微生物菌劑的企業(yè)事業(yè)法人，并具備微生物菌劑安全生產(chǎn)、使用、儲藏、運輸和應(yīng)急處置的能力。進口環(huán)保用微生物菌劑，應(yīng)當(dāng)按照本辦法的規(guī)定申請獲得《微生物菌劑樣品環(huán)境安全證明》，并憑該樣品環(huán)境安全證明依法辦理衛(wèi)生檢疫審批和現(xiàn)場查驗。

就當(dāng)下我國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)現(xiàn)狀，微生物菌劑一類的微生物產(chǎn)品是有很大的市場的，毋庸置疑。然而目前市場上微生物菌劑板塊尚缺乏龍頭領(lǐng)導(dǎo)企業(yè)，也沒有標(biāo)桿性產(chǎn)品。市場發(fā)展緩慢，很多時候，微生物菌劑要不然是小企業(yè)在做，要不然就是大企業(yè)下的一個很小的產(chǎn)品分支，很少有大企業(yè)專注做微生物菌劑類的微生物產(chǎn)品。是利益導(dǎo)向么？微生物菌劑有很大的市場空間，利益更不用說。所以關(guān)注中國農(nóng)業(yè)發(fā)展態(tài)勢，尤其是農(nóng)化產(chǎn)品使用的企業(yè)都知道，未來微生物菌劑產(chǎn)品市場必定會成為新的競技場。